Kabupaten Bone Bolango merupakan wilayah paling timur di provinsi Gorontalo, daerah ini dulunya merupakan wilayah dari kabupaten Gorontalo yang berpusat di Limboto. Dengan lahirnya Gorontalo menjadi sebuah provinsi, maka daerah ini dimekerkan bersamaan dengan kabupaten Pohuwato.
Kabupaten Bone Bolango sebelum dimekarkan memiliki empat kecamatan diantaranya kecamatan Suwawa, kecamatan Kabila, kecamatan Tapa dan kecamatan Bone Pantai, kemudian begitu dimekarkan maka empat kecamatan ini dilebur lagi menjadi beberapa kecamatan, yaitu :
- Kecamatan Tapa
- Kecamatan Bulango
- Kecamatan Bulango Timur
- Kecamatan Bulango Utara
- Kecamatan Bulango Ulu
- Kecamatan Tilongkabila
- Kecamatan Kabila
- Kecamatan Botupingge
- Kecamatan Suwawa
- Kecamatan Suwawa Timur
- Kecamatan Suwawa Selatan
- Kecamatan Suwawa Tengah
- Kecamatan Kabila Bone
- Kecamatan Bone Pantai
- Kecamatan Bone Raya
- Kecamatan Bulawa, dan terakhir
- Kecamatan Pinogu (Persiapan)
Kecamatan Suawa menjadi pusat pemerintahan di Bone Bolango, disanalah Kantor Bupati dan jajarannya berdiri menjalan roda pemerintahan. Saat ini bupati di Bone Bolango adalah Plt. Bupati Hamim Pou.
